BLASTN 2.2.3 [May-13-2002]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= BA0AB036F07LP1|AL430261
(927 letters)
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
1807 sequences; 10,358,551 total letters
Searching....done
Score E
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>3x_Contig1614
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>3x_Contig894
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Strand = Plus / Plus
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>3x_Contig1790
Length = 27369
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Strand = Plus / Minus
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Query: 478 accaccacccagccatagcctccatctggaacttttattttgttgtagctatcatcctca 537
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Query: 538 tcttctggcacagtctcaaattcataaatagtttgctccttttcgagtctgccaggatct 597
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Sbjct: 1118 tcttctggcacagtctcaaattcataaatagtttgctccttttcgagtctgccaggatct 1059
Query: 598 ttcaattctcctgctgaagaaatgtttgaagtttccaagctggtagcggcctctcctttc 657
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Sbjct: 1058 ttcaattctcctgctgaaggaatgtttgaagtttccaagctggtagcggtctctcctttc 999
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Sbjct: 938 gtccgagattgtaaagataaaaactgaccgtggagtattccgtcagttggtgtgcaacgt 879
Query: 777 cagattctttagaggtgtatttatatgtttccaggccaagaaaaaagaagaaaatacata 836
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Query: 837 ccaacaggagtagaatcaaaagagatagagtcaaaatttgtcatagaagatgagatgacc 896
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Sbjct: 818 ccaacacgagtagaatcaaaagagatagagtcaaaatttgtcataaaagatgagatgacc 759
Query: 897 cagcagaatatccgcagacatgaatac 923
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>3x_Contig1164
Length = 2302
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Identities = 651/688 (94%), Gaps = 3/688 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 243 caacattctgaatgacgattccaagcgaaatgagcttccttggtgaagtgtttatcaata 302
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Query: 303 tatagttgtacaagggagaaaaaagaaccccaacaccaaagctcaatccccc-aatggca 361
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Sbjct: 2232 tatagttgtacaaggcacaaaaaacacccccaacaccaaacctcaatccccccaatccca 2173
Query: 362 gcatagtcgagtttacctccagtttcgtattttccactatccatgtwatatgacaagtaa 421
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Sbjct: 2172 ccatactccagtttacctccagtttcctattttccactatccatctaatatcacaactaa 2113
Query: 422 acaccgtaaccatacgacgcaccagaggts-agaagtttaacaagaaggatgagaaaacc 480
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Sbjct: 2112 acaccctaaccatatgaaccaccagagctccagaagtttaacaagaaggatgagaaaacc 2053
Query: 481 accacccagccatagcctccatctggaacttttattttgttgtagctatcatcctcatct 540
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Sbjct: 2052 accacccagccatagcctccatctggaacttttattttgttgtagctatcatcctcatct 1993
Query: 541 tctggcacagtctcaaattcataaatagtttgctccttttcgagtctgccaggatctttc 600
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Sbjct: 1992 tctggcacagtctcaaattcataaatagtttgctccttttcgagtctgccaggatctttc 1933
Query: 601 aattctcctgctgaagaaatgtttgaagtttccaagctggtagcggcctctcctttctct 660
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Query: 721 cgaggttgtaaagataaaaactgatcgtgaagtaccccgtcagttggtgtgc-acgtcag 779
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Sbjct: 1812 cgaggttgtaaagataaaaactgaccgtgaagtatcccgtcggttggtgtgcaacgtcag 1753
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Sbjct: 1752 attctttagaggtatatttatatgtttccaggttaagaaaaaagaagaaaatacatacca 1693
Query: 840 acaggagtagaatcaaaagagatagagtcaaaatttgtcatagaagatgagatgacccag 899
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Sbjct: 1692 acaggagtagaatcaaaagagatagagtcaaaatttgtcatagaagatgagatgacccag 1633
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Sbjct: 1632 cagaatatccgcagacatgaatacaggt 1605
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
Posted date: Nov 27, 2002 12:23 PM
Number of letters in database: 10,358,551
Number of sequences in database: 1807
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
1.38 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 7324
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Number of sequences better than 1.0e-20: 5
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effective search space used: 9410301129
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A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.8 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
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